国交省の国土数値情報のサイトではいろいろなデータをダウンロードできるサービスがあります。
このうち避難施設の情報に標高のデータを追加してみます（どう使うかはこれから考えます）。
１：ファイルをダウンロード
ダウンロードとQGISへの読み込みなどは以下のページ参照
２：Shape形式をCSV形式に変換
QGISの機能を使います。
CSVで保存
注意：
たまに変換に失敗している場合があります。目視ででもチェックしておいてください。
これがベースデータになりますので大事です。そのまま使うとデータの欠損が起きることがあります。
例えば大阪の避難施設データでは3942と3943行目に問題が起きています。
欠けているのではなく軽く損傷しているデータです。これはExcelでCSVを外部テキストファイルとして読み込む場合に問題になります。
欠損データ対策は機械学習の前処理でも大事です。
参考までに、Excelによるデータークレンジング
３：座標データを取得
上記で保存したCSVから緯度・経度の列を抽出しておきます。
Excelを使いますが、無ければフリーのCSVイディー（インストール不要）やLibreOfficeのスプレッドシートなどでもいけます。
４：標高データを取得
この座標データを使って以下のページなどで標高を取得します。
一度に取得できる数は少ないので、地道にやっていきます。
座標+標高の形式で取得します、ローカルに保存。
取得した標高データを再度ExcelやCSVイディーなどで編集して元データに結合します。
５：CSV形式をShape形式に変換
再構成したCSVをQGISに読み込みます。
Shape形式に変換。
レイヤで右クリック －＞ エクスポート ー＞ 地物の保存
で、ESRI Shapefileを選んで保存します。
参考までに
国交省の国土数値情報には「河川」というのもあります。これは標高データも持っています。
河川端点が持つ標高値です（RiverNode.shp）。
こういうのと組み合わせると何かできるかも。
ただ、標高データの誤差はｃｍ単位どころではないので扱いが難しいです。
ちなみに河川データの属性
River －＞ W05_001 水系域
Stream －＞ W05_002 河川コード
Stream －＞ W05_003 区間種別
Stream －＞ W05_004 河川名
Stream －＞ W05_005 原典資料種別
Stream －＞ W05_006 流下方向判定
Stream －＞ W05_007 河川始点
Stream －＞ W05_008 河川終点
Stream －＞ W05_009 流路始点
Stream －＞ W05_010 流路終点
RiverNode －＞ W05_011 標高
また「浸水想定区域データ」というのもありますが、これはどう使っていいのか未だわかりません(^^)。
こういうデータをいろいろ料理する場合 －＞ GIS教材
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